Skip to main content
SearchLoginLogin or Signup

Reviews of "Genomic Epidemiology Uncovers the Timing and Origin of the Emergence of Mpox in Humans"

Reviewers: J M Wolf (Hospital Moinhos de Vento) | ๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—โ—ป๏ธ โ€ข G C Conant (North Carolina State University) | ๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜

Published onOct 11, 2024
Reviews of "Genomic Epidemiology Uncovers the Timing and Origin of the Emergence of Mpox in Humans"
key-enterThis Pub is a Review of
Genomic epidemiology uncovers the timing and origin of the emergence of mpox in humans
Genomic epidemiology uncovers the timing and origin of the emergence of mpox in humans
Description

Five years before the 2022โ€“2023 global mpox outbreak Nigeria reported its first cases in nearly 40 years, with the ongoing epidemic since driven by sustained human-to-human transmission. However, limited genomic data has left questions about the timing and origin of the mpox virusโ€™ (MPXV) emergence. Here we generated 112 MPXV genomes from Nigeria from 2021-2023. We identify the closest zoonotic outgroup to the human epidemic in southern Nigeria, and estimate that the lineage transmitting from human-to-human emerged around July 2014, circulating cryptically until detected in September 2017. The epidemic originated in Southern Nigeria, particularly Rivers State, which also acted as a persistent and dominant source of viral dissemination to other states. We show that APOBEC3 activity increased MPXVโ€™s evolutionary rate twenty-fold during human-to-human transmission. We also show how Delphy, a tool for near-real-time Bayesian phylogenetics, can aid rapid outbreak analytics. Our study sheds light on MPXVโ€™s establishment in West Africa before the 2022โ€“2023 global outbreak and highlights the need for improved pathogen surveillance and response.

To read the original manuscript, click the link above.

Summary of Reviews: The preprint "Genomic epidemiology uncovers the timing and origin of the emergence of mpox in humans" provides crucial insights into the origins and transmission dynamics of the mpox virus, particularly during the recent outbreak in Nigeria. By analyzing 112 genomes, the study highlights a 20-fold increase in viral mutation rates driven by host factors and traces years of undetected human-to-human transmission. While the studyโ€™s robust genomic analysis and advanced phylogenetic tools are commended, reviewers suggest improving clarity on molecular mechanisms, socio-economic influences, and surveillance strategies. Overall, this research offers valuable contributions to understanding mpox evolution and guiding future outbreak monitoring and prevention.

Reviewer 1 (Jonas Michel Wโ€ฆ) | ๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—โ—ป๏ธ

Reviewer 2 (Gavin Cโ€ฆ) | ๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜

RR\ID Strength of Evidence Scale Key

๐Ÿ“• โ—ป๏ธโ—ป๏ธโ—ป๏ธโ—ป๏ธ = Misleading

๐Ÿ“™๐Ÿ“™ โ—ป๏ธโ—ป๏ธโ—ป๏ธ = Not Informative

๐Ÿ“’๐Ÿ“’๐Ÿ“’ โ—ป๏ธโ—ป๏ธ = Potentially Informative

๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—๐Ÿ“—โ—ป๏ธ = Reliable

๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜๐Ÿ“˜ = Strong

To read the reviews, click the links below.ย 

Comments
27
?
Bande mr:

Ang $100 bonus ay saโ€™yo na! Mag-register sa diamond game - https://diamond-game-ph.com at simulan ang masaya at panalong karanasan online.

?
Bande mr:

Simpleng proseso, malaking panalo! Magparehistro na sa 7up gaming - https://7up-gaming-ph.com at kunin ang $100 bonus para sa iyong unang laro.

?
Bande mr:

Ang tagumpay ay nagsisimula sa cgebet - https://cgebet-ph.com! Maging bagong miyembro at tamasahin ang dagdag na $100 bonus.

?
Bande mr:

Mag-sign up ngayon sa 8k8 - https://8k8-8.com at tanggapin ang $100 welcome bonus. Maging panalo mula sa simula!

?
Bande mr:

Huwag magpahuli! Ang phoenix game - https://phoenix-game-ph.com ay may espesyal na alok para sa mga bagong miyembroโ€”ang $100 bonus na magpapasaya sa iyong laro.

?
Bande mr:

Ang $100 bonus ay saโ€™yo na! Mag-register sa 55bmw - https://55bmw-88.com at simulan ang iyong gaming journey nang may dagdag na pondo.

?
Bande mr:

Panalo agad! Magparehistro bilang bagong miyembro sa jiliko - https://jiliko-8.com at tanggapin ang eksklusibong $100 bonus.

?
Bande mr:

Maging bahagi ng phlove - https://phlove-8.com at simulan ang panalo! Mag-sign up at tanggapin ang $100 bonus na magpapasaya sa iyong unang laro.

?
Bande mr:

Huwag palampasin ang alok ng nn777 - https://nn777-8.com! Magparehistro na at tanggapin ang $100 bonus para sa iyong unang taya.

?
Bande mr:

Ang $100 bonus ay naghihintay sa iyo! Mag-sign up na sa jili777 - https://jili777-8.com at gawing mas kapana-panabik ang bawat laro.

?
Bande mr:

Bagong simula, bagong swerte! Magparehistro sa nice88 - https://nice88-8.com ngayon at kunin ang iyong $100 welcome bonus. Mas malaking panalo, mas masayang laro!

?
Bande mr:

Ang $100 bonus ng ubet95 - https://ubet95-8.com ay para sa iyo! Maging bagong miyembro at i-enjoy ang libreng pondo para sa mas masayang paglalaro.

?
Bande mr:

Simulan ang iyong panalong kwento sa jolibet - https://jolibet-8.com! Mag-sign up na at tanggapin ang $100 bonus na magdadagdag sa iyong mga pagkakataong manalo.

?
Bande mr:

Ang swerte ay nasa iyong kamay! Magparehistro sa gold99 - https://gold99-8.com ngayon at tanggapin ang eksklusibong $100 bonus para sa mga bagong miyembro.

?
Bande mr:

Magsimula ng tama sa mwplay888 - https://mwplay888-8.com! Mag-sign up at tanggapin ang $100 welcome bonus para magamit sa slots, live casino, o sports betting.

?
Bande mr:

Ikaw baโ€™y naghahanap ng masuwerteng simula? Narito na ang 63jili - https://63jili-8.com na may $100 bonus para sa lahat ng bagong miyembro! Magparehistro na at tamasahin ang dagdag na pondo.

?
Bande mr:

Panalo mula sa simula! Sumali sa unobet - https://unobet-8.com bilang bagong miyembro at makatanggap ng $100 bonus na magagamit sa paborito mong laro.

?
Bande mr:

Huwag nang maghintay pa! Ang $100 welcome bonus ng phl63 - https://phl63-8.com ay para lamang sa mga bagong miyembro. Mag-register na at simulan ang kasiyahan online.

?
Bande mr:

Ang kasiyahan ay nagsisimula sa tayabet - https://tayabet-8.com! Mag-sign up na at tamasahin ang iyong $100 welcome bonus para mas maraming panalo. Siguradong sulit ang bawat taya!

?
Bande mr:

Magsimula ng masaya at panalong adventure sa rich711 - https://rich711-8.com! Mag-register ngayon at makakuha ng eksklusibong $100 bonus na magbibigay saโ€™yo ng edge sa bawat laro.

?
Bande mr:

Ang jili slot - https://jili-slot-8.com ay para sa mga panalo! Maging bagong miyembro at tanggapin ang iyong $100 welcome bonus. Simple lang ang prosesoโ€”mag-register, mag-deposito, at simulan ang kasiyahan!

?
Bande mr:

Bagong miyembro? Narito na ang iyong pagkakataon na maglaro gamit ang dagdag na $100 bonus. Magparehistro lamang sa jollibet - https://jollibet-8.com at tangkilikin ang walang kapantay na gaming experience.

?
Bande mr:

Huwag palampasin ang pagkakataon! Sumali sa melbet - https://melbet-8.com ngayon at tanggapin ang $100 bonus para sa iyong unang laro. Maglaro ng slots, roulette, o kahit sports betting gamit ang libreng pondo!

?
Bande mr:

Ang swerte moโ€™y magsisimula sa 99bet - https://99bet-8.com! Mag-sign up bilang bagong miyembro at awtomatikong makakuha ng $100 bonus. Punan lamang ang simpleng form ng registration at i-enjoy ang mga premium na laro online.

?
Bande mr:

Magparehistro ngayon sa inplay - https://inplay-8.com at tanggapin ang iyong $100 welcome bonus! Napakadaling sumali, at siguradong panalo ka na agad mula sa simula. Subukan ang slots, live casino, at sports betting na may dagdag na pondo para sa mas malaking pagkakataong manalo.

?
immanuel johnston:

To help understand slope how mpox came to be and how it spreads, this synopsis focuses on the most crucial points made in the preprint.